Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ube3dQ8BX13 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ube3dQ8BX13 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ube3dQ8BX13 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ube3dQ8BX13 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ube3dQ8BX13 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ube3dQ8BX13 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ube3dQ8BX13 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube3dQ8BX13 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube3dQ8BX13 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube3dQ8BX13 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube3dQ8BX13 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube3dQ8BX13 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube3dQ8BX13 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube3dQ8BX13 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube3dQ8BX13 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube3dQ8BX13 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube3dQ8BX13 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube3dQ8BX13 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube3dQ8BX13 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube3dQ8BX13 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube3dQ8BX13 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube3dQ8BX13 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube3dQ8BX13 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube3dQ8BX13 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube3dQ8BX13 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube3dQ8BX13 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube3dQ8BX13 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube3dQ8BX13 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube3dQ8BX13 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube3dQ8BX13 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube3dQ8BX13 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube3dQ8BX13 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube3dQ8BX13 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube3dQ8BX13 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube3dQ8BX13 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube3dQ8BX13 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube3dQ8BX13 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube3dQ8BX13 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube3dQ8BX13 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube3dQ8BX13 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube3dQ8BX13 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube3dQ8BX13 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube3dQ8BX13 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube3dQ8BX13 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube3dQ8BX13 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube3dQ8BX13 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube3dQ8BX13 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube3dQ8BX13 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube3dQ8BX13 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube3dQ8BX13 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube3dQ8BX13 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube3dQ8BX13 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Ube3dQ8BX13 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube3dQ8BX13 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Ube3dQ8BX13 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Ube3dQ8BX13 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube3dQ8BX13 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube3dQ8BX13 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube3dQ8BX13 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube3dQ8BX13 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube3dQ8BX13 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube3dQ8BX13 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube3dQ8BX13 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube3dQ8BX13 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube3dQ8BX13 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube3dQ8BX13 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube3dQ8BX13 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube3dQ8BX13 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube3dQ8BX13 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube3dQ8BX13 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube3dQ8BX13 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube3dQ8BX13 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube3dQ8BX13 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube3dQ8BX13 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube3dQ8BX13 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube3dQ8BX13 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube3dQ8BX13 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube3dQ8BX13 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ube3dQ8BX13 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ube3dQ8BX13 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ube3dQ8BX13 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ube3dQ8BX13 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ube3dQ8BX13 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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