Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVP1

Triml1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIML1, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Triml1Q8BVP1 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms