Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms