Protein–RNA interactions for Protein: Q80VR2

Ell3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell3Q80VR2 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ell3Q80VR2 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ell3Q80VR2 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ell3Q80VR2 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ell3Q80VR2 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ell3Q80VR2 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ell3Q80VR2 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ell3Q80VR2 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ell3Q80VR2 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ell3Q80VR2 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ell3Q80VR2 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ell3Q80VR2 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ell3Q80VR2 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ell3Q80VR2 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ell3Q80VR2 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ell3Q80VR2 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ell3Q80VR2 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ell3Q80VR2 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ell3Q80VR2 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ell3Q80VR2 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ell3Q80VR2 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ell3Q80VR2 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ell3Q80VR2 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ell3Q80VR2 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ell3Q80VR2 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ell3Q80VR2 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ell3Q80VR2 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ell3Q80VR2 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ell3Q80VR2 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ell3Q80VR2 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ell3Q80VR2 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ell3Q80VR2 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ell3Q80VR2 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ell3Q80VR2 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ell3Q80VR2 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ell3Q80VR2 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ell3Q80VR2 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ell3Q80VR2 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ell3Q80VR2 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ell3Q80VR2 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ell3Q80VR2 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ell3Q80VR2 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ell3Q80VR2 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ell3Q80VR2 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ell3Q80VR2 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ell3Q80VR2 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ell3Q80VR2 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ell3Q80VR2 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ell3Q80VR2 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ell3Q80VR2 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ell3Q80VR2 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ell3Q80VR2 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ell3Q80VR2 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ell3Q80VR2 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ell3Q80VR2 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ell3Q80VR2 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ell3Q80VR2 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ell3Q80VR2 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ell3Q80VR2 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ell3Q80VR2 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ell3Q80VR2 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ell3Q80VR2 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ell3Q80VR2 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ell3Q80VR2 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ell3Q80VR2 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ell3Q80VR2 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ell3Q80VR2 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ell3Q80VR2 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ell3Q80VR2 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ell3Q80VR2 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ell3Q80VR2 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ell3Q80VR2 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ell3Q80VR2 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ell3Q80VR2 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ell3Q80VR2 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ell3Q80VR2 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ell3Q80VR2 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ell3Q80VR2 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ell3Q80VR2 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ell3Q80VR2 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ell3Q80VR2 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ell3Q80VR2 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ell3Q80VR2 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ell3Q80VR2 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ell3Q80VR2 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ell3Q80VR2 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ell3Q80VR2 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ell3Q80VR2 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ell3Q80VR2 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ell3Q80VR2 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ell3Q80VR2 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ell3Q80VR2 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ell3Q80VR2 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ell3Q80VR2 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ell3Q80VR2 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ell3Q80VR2 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ell3Q80VR2 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ell3Q80VR2 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ell3Q80VR2 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ell3Q80VR2 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms