Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM8

Pnma8a, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma8aQ80VM8 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pnma8aQ80VM8 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pnma8aQ80VM8 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pnma8aQ80VM8 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pnma8aQ80VM8 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pnma8aQ80VM8 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pnma8aQ80VM8 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pnma8aQ80VM8 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pnma8aQ80VM8 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pnma8aQ80VM8 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pnma8aQ80VM8 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pnma8aQ80VM8 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pnma8aQ80VM8 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pnma8aQ80VM8 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pnma8aQ80VM8 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pnma8aQ80VM8 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pnma8aQ80VM8 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pnma8aQ80VM8 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pnma8aQ80VM8 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pnma8aQ80VM8 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pnma8aQ80VM8 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pnma8aQ80VM8 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pnma8aQ80VM8 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pnma8aQ80VM8 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pnma8aQ80VM8 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pnma8aQ80VM8 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pnma8aQ80VM8 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pnma8aQ80VM8 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pnma8aQ80VM8 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pnma8aQ80VM8 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms