Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms