Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nphp3Q7TNH6 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nphp3Q7TNH6 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nphp3Q7TNH6 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nphp3Q7TNH6 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nphp3Q7TNH6 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nphp3Q7TNH6 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nphp3Q7TNH6 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nphp3Q7TNH6 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nphp3Q7TNH6 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nphp3Q7TNH6 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nphp3Q7TNH6 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nphp3Q7TNH6 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nphp3Q7TNH6 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nphp3Q7TNH6 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nphp3Q7TNH6 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nphp3Q7TNH6 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nphp3Q7TNH6 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nphp3Q7TNH6 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nphp3Q7TNH6 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nphp3Q7TNH6 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nphp3Q7TNH6 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nphp3Q7TNH6 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nphp3Q7TNH6 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nphp3Q7TNH6 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nphp3Q7TNH6 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nphp3Q7TNH6 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nphp3Q7TNH6 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nphp3Q7TNH6 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nphp3Q7TNH6 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nphp3Q7TNH6 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nphp3Q7TNH6 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nphp3Q7TNH6 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nphp3Q7TNH6 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nphp3Q7TNH6 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nphp3Q7TNH6 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nphp3Q7TNH6 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nphp3Q7TNH6 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nphp3Q7TNH6 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nphp3Q7TNH6 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nphp3Q7TNH6 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nphp3Q7TNH6 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nphp3Q7TNH6 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nphp3Q7TNH6 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nphp3Q7TNH6 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nphp3Q7TNH6 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nphp3Q7TNH6 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nphp3Q7TNH6 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nphp3Q7TNH6 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nphp3Q7TNH6 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nphp3Q7TNH6 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nphp3Q7TNH6 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nphp3Q7TNH6 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nphp3Q7TNH6 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nphp3Q7TNH6 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nphp3Q7TNH6 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nphp3Q7TNH6 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nphp3Q7TNH6 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nphp3Q7TNH6 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nphp3Q7TNH6 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nphp3Q7TNH6 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nphp3Q7TNH6 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nphp3Q7TNH6 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nphp3Q7TNH6 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nphp3Q7TNH6 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nphp3Q7TNH6 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nphp3Q7TNH6 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nphp3Q7TNH6 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nphp3Q7TNH6 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nphp3Q7TNH6 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nphp3Q7TNH6 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nphp3Q7TNH6 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nphp3Q7TNH6 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nphp3Q7TNH6 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nphp3Q7TNH6 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nphp3Q7TNH6 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nphp3Q7TNH6 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nphp3Q7TNH6 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nphp3Q7TNH6 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nphp3Q7TNH6 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nphp3Q7TNH6 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nphp3Q7TNH6 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nphp3Q7TNH6 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nphp3Q7TNH6 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nphp3Q7TNH6 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nphp3Q7TNH6 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nphp3Q7TNH6 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nphp3Q7TNH6 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nphp3Q7TNH6 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nphp3Q7TNH6 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nphp3Q7TNH6 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nphp3Q7TNH6 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nphp3Q7TNH6 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nphp3Q7TNH6 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nphp3Q7TNH6 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nphp3Q7TNH6 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nphp3Q7TNH6 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nphp3Q7TNH6 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nphp3Q7TNH6 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nphp3Q7TNH6 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms