Protein–RNA interactions for Protein: Q7M729

Scn4b, Sodium channel subunit beta-4, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4bQ7M729 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
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Scn4bQ7M729 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Scn4bQ7M729 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Scn4bQ7M729 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Scn4bQ7M729 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Scn4bQ7M729 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Scn4bQ7M729 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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