Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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ScocQ78YZ6 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ScocQ78YZ6 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ScocQ78YZ6 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ScocQ78YZ6 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ScocQ78YZ6 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
ScocQ78YZ6 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ScocQ78YZ6 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ScocQ78YZ6 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ScocQ78YZ6 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ScocQ78YZ6 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ScocQ78YZ6 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ScocQ78YZ6 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ScocQ78YZ6 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
ScocQ78YZ6 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
ScocQ78YZ6 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ScocQ78YZ6 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ScocQ78YZ6 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ScocQ78YZ6 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ScocQ78YZ6 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ScocQ78YZ6 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ScocQ78YZ6 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ScocQ78YZ6 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ScocQ78YZ6 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ScocQ78YZ6 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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ScocQ78YZ6 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ScocQ78YZ6 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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ScocQ78YZ6 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ScocQ78YZ6 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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ScocQ78YZ6 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ScocQ78YZ6 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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ScocQ78YZ6 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ScocQ78YZ6 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
ScocQ78YZ6 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ScocQ78YZ6 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ScocQ78YZ6 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ScocQ78YZ6 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ScocQ78YZ6 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ScocQ78YZ6 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ScocQ78YZ6 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ScocQ78YZ6 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ScocQ78YZ6 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ScocQ78YZ6 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ScocQ78YZ6 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ScocQ78YZ6 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
ScocQ78YZ6 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ScocQ78YZ6 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ScocQ78YZ6 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ScocQ78YZ6 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
ScocQ78YZ6 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ScocQ78YZ6 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ScocQ78YZ6 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
ScocQ78YZ6 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
ScocQ78YZ6 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ScocQ78YZ6 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ScocQ78YZ6 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ScocQ78YZ6 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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