Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rftn1Q6A0D4 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rftn1Q6A0D4 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rftn1Q6A0D4 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Rftn1Q6A0D4 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
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Rftn1Q6A0D4 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Rftn1Q6A0D4 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Rftn1Q6A0D4 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rftn1Q6A0D4 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rftn1Q6A0D4 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rftn1Q6A0D4 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rftn1Q6A0D4 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rftn1Q6A0D4 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rftn1Q6A0D4 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rftn1Q6A0D4 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rftn1Q6A0D4 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Rftn1Q6A0D4 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
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