Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms