Protein–RNA interactions for Protein: Q61474

Msi1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi1Q61474 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms