Protein–RNA interactions for Protein: Q61124

Cln3, Battenin, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln3Q61124 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Gm45251-201ENSMUST00000209486 1465 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Cln3Q61124 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Cln3Q61124 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Cln3Q61124 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Cln3Q61124 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Cln3Q61124 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Cln3Q61124 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Cln3Q61124 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Cln3Q61124 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms