Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
JrkQ60976 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
JrkQ60976 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
JrkQ60976 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
JrkQ60976 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
JrkQ60976 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
JrkQ60976 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
JrkQ60976 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
JrkQ60976 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
JrkQ60976 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
JrkQ60976 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
JrkQ60976 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
JrkQ60976 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
JrkQ60976 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
JrkQ60976 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
JrkQ60976 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
JrkQ60976 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
JrkQ60976 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
JrkQ60976 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
JrkQ60976 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
JrkQ60976 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
JrkQ60976 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
JrkQ60976 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
JrkQ60976 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
JrkQ60976 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
JrkQ60976 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
JrkQ60976 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
JrkQ60976 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms