Protein–RNA interactions for Protein: Q60974

Ncor1, Nuclear receptor corepressor 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ncor1Q60974 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ncor1Q60974 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ncor1Q60974 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ncor1Q60974 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ncor1Q60974 4933428M09Rik-201ENSMUST00000113046 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ncor1Q60974 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ncor1Q60974 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ncor1Q60974 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ncor1Q60974 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ncor1Q60974 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ncor1Q60974 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ncor1Q60974 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ncor1Q60974 Gm18552-201ENSMUST00000187425 538 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ncor1Q60974 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ncor1Q60974 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ncor1Q60974 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ncor1Q60974 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ncor1Q60974 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ncor1Q60974 Rhno1-207ENSMUST00000223237 1081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ncor1Q60974 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ncor1Q60974 Tnfrsf18-201ENSMUST00000040274 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Ncor1Q60974 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ncor1Q60974 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ncor1Q60974 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ncor1Q60974 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ncor1Q60974 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ncor1Q60974 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ncor1Q60974 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ncor1Q60974 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ncor1Q60974 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ncor1Q60974 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ncor1Q60974 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ncor1Q60974 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ncor1Q60974 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Ncor1Q60974 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ncor1Q60974 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
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Ncor1Q60974 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ncor1Q60974 Mcpt4-201ENSMUST00000043249 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ncor1Q60974 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ncor1Q60974 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ncor1Q60974 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ncor1Q60974 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ncor1Q60974 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ncor1Q60974 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ncor1Q60974 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Ncor1Q60974 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ncor1Q60974 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Ncor1Q60974 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ncor1Q60974 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Ncor1Q60974 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Ncor1Q60974 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Ncor1Q60974 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ncor1Q60974 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ncor1Q60974 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ncor1Q60974 Izumo1r-202ENSMUST00000069408 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ncor1Q60974 Rps18-201ENSMUST00000008812 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ncor1Q60974 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ncor1Q60974 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ncor1Q60974 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ncor1Q60974 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ncor1Q60974 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ncor1Q60974 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ncor1Q60974 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ncor1Q60974 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ncor1Q60974 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ncor1Q60974 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ncor1Q60974 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ncor1Q60974 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ncor1Q60974 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ncor1Q60974 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ncor1Q60974 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ncor1Q60974 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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