Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Traf3Q60803 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Traf3Q60803 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Traf3Q60803 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Traf3Q60803 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Traf3Q60803 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Traf3Q60803 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Traf3Q60803 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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