Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atf3Q60765 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Atf3Q60765 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atf3Q60765 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atf3Q60765 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Atf3Q60765 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atf3Q60765 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atf3Q60765 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atf3Q60765 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atf3Q60765 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atf3Q60765 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atf3Q60765 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atf3Q60765 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atf3Q60765 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atf3Q60765 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atf3Q60765 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atf3Q60765 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atf3Q60765 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atf3Q60765 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atf3Q60765 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atf3Q60765 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atf3Q60765 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atf3Q60765 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atf3Q60765 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atf3Q60765 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atf3Q60765 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atf3Q60765 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atf3Q60765 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atf3Q60765 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atf3Q60765 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Atf3Q60765 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atf3Q60765 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atf3Q60765 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atf3Q60765 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atf3Q60765 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atf3Q60765 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atf3Q60765 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atf3Q60765 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atf3Q60765 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atf3Q60765 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atf3Q60765 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atf3Q60765 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atf3Q60765 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atf3Q60765 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atf3Q60765 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atf3Q60765 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atf3Q60765 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atf3Q60765 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atf3Q60765 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atf3Q60765 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Atf3Q60765 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atf3Q60765 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Atf3Q60765 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atf3Q60765 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atf3Q60765 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atf3Q60765 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Atf3Q60765 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atf3Q60765 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Atf3Q60765 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atf3Q60765 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atf3Q60765 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atf3Q60765 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atf3Q60765 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atf3Q60765 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atf3Q60765 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atf3Q60765 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atf3Q60765 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atf3Q60765 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atf3Q60765 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atf3Q60765 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atf3Q60765 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atf3Q60765 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atf3Q60765 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atf3Q60765 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atf3Q60765 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atf3Q60765 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atf3Q60765 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atf3Q60765 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atf3Q60765 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atf3Q60765 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atf3Q60765 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atf3Q60765 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atf3Q60765 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atf3Q60765 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atf3Q60765 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atf3Q60765 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Atf3Q60765 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atf3Q60765 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Atf3Q60765 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Atf3Q60765 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Atf3Q60765 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atf3Q60765 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atf3Q60765 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atf3Q60765 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atf3Q60765 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atf3Q60765 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atf3Q60765 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Atf3Q60765 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Atf3Q60765 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atf3Q60765 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms