Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG71

Utp20, Small subunit processome component 20 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,788 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp20Q5XG71 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Utp20Q5XG71 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Utp20Q5XG71 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Utp20Q5XG71 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Utp20Q5XG71 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Utp20Q5XG71 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Utp20Q5XG71 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Utp20Q5XG71 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Utp20Q5XG71 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Utp20Q5XG71 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Utp20Q5XG71 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Utp20Q5XG71 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Utp20Q5XG71 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Utp20Q5XG71 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Utp20Q5XG71 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Utp20Q5XG71 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Utp20Q5XG71 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Utp20Q5XG71 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Utp20Q5XG71 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Utp20Q5XG71 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Utp20Q5XG71 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Utp20Q5XG71 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Utp20Q5XG71 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Utp20Q5XG71 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Utp20Q5XG71 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Utp20Q5XG71 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Utp20Q5XG71 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Utp20Q5XG71 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Utp20Q5XG71 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Utp20Q5XG71 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Utp20Q5XG71 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Utp20Q5XG71 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Utp20Q5XG71 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Utp20Q5XG71 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Utp20Q5XG71 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Utp20Q5XG71 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Utp20Q5XG71 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Utp20Q5XG71 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Utp20Q5XG71 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Utp20Q5XG71 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Utp20Q5XG71 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Utp20Q5XG71 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Utp20Q5XG71 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Utp20Q5XG71 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Utp20Q5XG71 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Utp20Q5XG71 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Utp20Q5XG71 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Utp20Q5XG71 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Utp20Q5XG71 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Utp20Q5XG71 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Utp20Q5XG71 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Utp20Q5XG71 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Utp20Q5XG71 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Utp20Q5XG71 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Utp20Q5XG71 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Utp20Q5XG71 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Utp20Q5XG71 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Utp20Q5XG71 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Utp20Q5XG71 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Utp20Q5XG71 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Utp20Q5XG71 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Utp20Q5XG71 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Utp20Q5XG71 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Utp20Q5XG71 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Utp20Q5XG71 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Utp20Q5XG71 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Utp20Q5XG71 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Utp20Q5XG71 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Utp20Q5XG71 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Utp20Q5XG71 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Utp20Q5XG71 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Utp20Q5XG71 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Utp20Q5XG71 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Utp20Q5XG71 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Utp20Q5XG71 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Utp20Q5XG71 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Utp20Q5XG71 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Utp20Q5XG71 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Utp20Q5XG71 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Utp20Q5XG71 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Utp20Q5XG71 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Utp20Q5XG71 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Utp20Q5XG71 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Utp20Q5XG71 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Utp20Q5XG71 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Utp20Q5XG71 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Utp20Q5XG71 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Utp20Q5XG71 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Utp20Q5XG71 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Utp20Q5XG71 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Utp20Q5XG71 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Utp20Q5XG71 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Utp20Q5XG71 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Utp20Q5XG71 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Utp20Q5XG71 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Utp20Q5XG71 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Utp20Q5XG71 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Utp20Q5XG71 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Utp20Q5XG71 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Utp20Q5XG71 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms