Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psme4Q5SSW2 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psme4Q5SSW2 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psme4Q5SSW2 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psme4Q5SSW2 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psme4Q5SSW2 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psme4Q5SSW2 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psme4Q5SSW2 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Psme4Q5SSW2 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psme4Q5SSW2 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psme4Q5SSW2 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psme4Q5SSW2 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Psme4Q5SSW2 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Psme4Q5SSW2 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psme4Q5SSW2 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Psme4Q5SSW2 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Psme4Q5SSW2 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Psme4Q5SSW2 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Psme4Q5SSW2 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Psme4Q5SSW2 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Psme4Q5SSW2 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psme4Q5SSW2 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psme4Q5SSW2 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psme4Q5SSW2 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psme4Q5SSW2 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psme4Q5SSW2 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psme4Q5SSW2 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Psme4Q5SSW2 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psme4Q5SSW2 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Psme4Q5SSW2 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Psme4Q5SSW2 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Psme4Q5SSW2 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Psme4Q5SSW2 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Psme4Q5SSW2 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psme4Q5SSW2 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Psme4Q5SSW2 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psme4Q5SSW2 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psme4Q5SSW2 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psme4Q5SSW2 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psme4Q5SSW2 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psme4Q5SSW2 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psme4Q5SSW2 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psme4Q5SSW2 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psme4Q5SSW2 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Psme4Q5SSW2 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psme4Q5SSW2 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psme4Q5SSW2 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psme4Q5SSW2 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psme4Q5SSW2 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psme4Q5SSW2 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psme4Q5SSW2 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psme4Q5SSW2 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psme4Q5SSW2 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Psme4Q5SSW2 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Psme4Q5SSW2 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Psme4Q5SSW2 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Psme4Q5SSW2 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Psme4Q5SSW2 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Psme4Q5SSW2 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Psme4Q5SSW2 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Psme4Q5SSW2 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psme4Q5SSW2 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psme4Q5SSW2 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Psme4Q5SSW2 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psme4Q5SSW2 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psme4Q5SSW2 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Psme4Q5SSW2 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psme4Q5SSW2 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psme4Q5SSW2 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psme4Q5SSW2 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psme4Q5SSW2 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psme4Q5SSW2 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Psme4Q5SSW2 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psme4Q5SSW2 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Psme4Q5SSW2 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psme4Q5SSW2 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Psme4Q5SSW2 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psme4Q5SSW2 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psme4Q5SSW2 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psme4Q5SSW2 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psme4Q5SSW2 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms