Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

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Length 599 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rtl5Q5DTT4 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
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Rtl5Q5DTT4 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rtl5Q5DTT4 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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Rtl5Q5DTT4 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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Rtl5Q5DTT4 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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Rtl5Q5DTT4 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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Rtl5Q5DTT4 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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Rtl5Q5DTT4 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rtl5Q5DTT4 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rtl5Q5DTT4 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rtl5Q5DTT4 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rtl5Q5DTT4 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rtl5Q5DTT4 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rtl5Q5DTT4 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
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Rtl5Q5DTT4 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Rtl5Q5DTT4 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rtl5Q5DTT4 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rtl5Q5DTT4 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rtl5Q5DTT4 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rtl5Q5DTT4 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rtl5Q5DTT4 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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