Protein–RNA interactions for Protein: Q3V089

Rbm44, RNA-binding protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm44Q3V089 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms