Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR9

Sbspon, Somatomedin-B and thrombospondin type-1 domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsponQ3UPR9 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms