Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms