Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms