Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hace1Q3U0D9 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Hace1Q3U0D9 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hace1Q3U0D9 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hace1Q3U0D9 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hace1Q3U0D9 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hace1Q3U0D9 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hace1Q3U0D9 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Hace1Q3U0D9 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hace1Q3U0D9 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hace1Q3U0D9 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Hace1Q3U0D9 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Hace1Q3U0D9 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Hace1Q3U0D9 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Hace1Q3U0D9 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Hace1Q3U0D9 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Hace1Q3U0D9 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Hace1Q3U0D9 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Hace1Q3U0D9 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Hace1Q3U0D9 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Hace1Q3U0D9 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Hace1Q3U0D9 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Hace1Q3U0D9 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Hace1Q3U0D9 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Hace1Q3U0D9 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Hace1Q3U0D9 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Hace1Q3U0D9 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Hace1Q3U0D9 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Hace1Q3U0D9 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Hace1Q3U0D9 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Hace1Q3U0D9 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Hace1Q3U0D9 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Hace1Q3U0D9 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Hace1Q3U0D9 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Hace1Q3U0D9 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Hace1Q3U0D9 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Hace1Q3U0D9 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Hace1Q3U0D9 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Hace1Q3U0D9 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Hace1Q3U0D9 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Hace1Q3U0D9 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Hace1Q3U0D9 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Hace1Q3U0D9 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Hace1Q3U0D9 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Hace1Q3U0D9 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Hace1Q3U0D9 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Hace1Q3U0D9 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Hace1Q3U0D9 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Hace1Q3U0D9 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Hace1Q3U0D9 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Hace1Q3U0D9 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Hace1Q3U0D9 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Hace1Q3U0D9 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Hace1Q3U0D9 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Hace1Q3U0D9 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Hace1Q3U0D9 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Hace1Q3U0D9 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Hace1Q3U0D9 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Hace1Q3U0D9 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Hace1Q3U0D9 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Hace1Q3U0D9 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Hace1Q3U0D9 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Hace1Q3U0D9 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Hace1Q3U0D9 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Hace1Q3U0D9 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Hace1Q3U0D9 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Hace1Q3U0D9 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Hace1Q3U0D9 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Hace1Q3U0D9 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Hace1Q3U0D9 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Hace1Q3U0D9 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Hace1Q3U0D9 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Hace1Q3U0D9 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Hace1Q3U0D9 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Hace1Q3U0D9 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Hace1Q3U0D9 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Hace1Q3U0D9 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Hace1Q3U0D9 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Hace1Q3U0D9 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Hace1Q3U0D9 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Hace1Q3U0D9 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Hace1Q3U0D9 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Hace1Q3U0D9 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Hace1Q3U0D9 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Hace1Q3U0D9 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Hace1Q3U0D9 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Hace1Q3U0D9 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Hace1Q3U0D9 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Hace1Q3U0D9 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Hace1Q3U0D9 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Hace1Q3U0D9 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Hace1Q3U0D9 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Hace1Q3U0D9 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Hace1Q3U0D9 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Hace1Q3U0D9 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Hace1Q3U0D9 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Hace1Q3U0D9 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Hace1Q3U0D9 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Hace1Q3U0D9 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Hace1Q3U0D9 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms