Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ctdnep1Q3TP92 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Ctdnep1Q3TP92 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Ctdnep1Q3TP92 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Ctdnep1Q3TP92 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Ctdnep1Q3TP92 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Ctdnep1Q3TP92 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Ctdnep1Q3TP92 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Ctdnep1Q3TP92 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Ctdnep1Q3TP92 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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