Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

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Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms