Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TrioQ0KL02 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TrioQ0KL02 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TrioQ0KL02 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TrioQ0KL02 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TrioQ0KL02 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
TrioQ0KL02 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
TrioQ0KL02 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TrioQ0KL02 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TrioQ0KL02 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TrioQ0KL02 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
TrioQ0KL02 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TrioQ0KL02 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TrioQ0KL02 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TrioQ0KL02 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TrioQ0KL02 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TrioQ0KL02 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TrioQ0KL02 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TrioQ0KL02 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TrioQ0KL02 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TrioQ0KL02 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TrioQ0KL02 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
TrioQ0KL02 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
TrioQ0KL02 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TrioQ0KL02 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TrioQ0KL02 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TrioQ0KL02 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TrioQ0KL02 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TrioQ0KL02 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TrioQ0KL02 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TrioQ0KL02 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TrioQ0KL02 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
TrioQ0KL02 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TrioQ0KL02 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TrioQ0KL02 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TrioQ0KL02 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TrioQ0KL02 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TrioQ0KL02 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TrioQ0KL02 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TrioQ0KL02 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
TrioQ0KL02 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TrioQ0KL02 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TrioQ0KL02 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TrioQ0KL02 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
TrioQ0KL02 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
TrioQ0KL02 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TrioQ0KL02 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TrioQ0KL02 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TrioQ0KL02 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
TrioQ0KL02 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TrioQ0KL02 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
TrioQ0KL02 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
TrioQ0KL02 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TrioQ0KL02 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
TrioQ0KL02 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TrioQ0KL02 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TrioQ0KL02 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TrioQ0KL02 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TrioQ0KL02 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TrioQ0KL02 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TrioQ0KL02 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TrioQ0KL02 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TrioQ0KL02 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TrioQ0KL02 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TrioQ0KL02 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TrioQ0KL02 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TrioQ0KL02 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TrioQ0KL02 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TrioQ0KL02 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TrioQ0KL02 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TrioQ0KL02 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TrioQ0KL02 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TrioQ0KL02 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms