Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnnm1Q0GA42 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnnm1Q0GA42 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnnm1Q0GA42 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnnm1Q0GA42 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnnm1Q0GA42 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnnm1Q0GA42 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnnm1Q0GA42 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnnm1Q0GA42 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnnm1Q0GA42 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnnm1Q0GA42 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnnm1Q0GA42 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnnm1Q0GA42 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnnm1Q0GA42 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnnm1Q0GA42 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnnm1Q0GA42 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnnm1Q0GA42 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnnm1Q0GA42 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnnm1Q0GA42 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnnm1Q0GA42 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnnm1Q0GA42 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnnm1Q0GA42 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnnm1Q0GA42 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnnm1Q0GA42 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnnm1Q0GA42 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnnm1Q0GA42 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnnm1Q0GA42 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnnm1Q0GA42 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnnm1Q0GA42 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnnm1Q0GA42 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnnm1Q0GA42 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms