Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Gm23757-201ENSMUST00000158353 100 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Vmn1r139-201ENSMUST00000169730 894 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Vmn1r112-201ENSMUST00000174538 894 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Vmn1r157-201ENSMUST00000178215 894 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Ermard-209ENSMUST00000226561 1019 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Spink12-201ENSMUST00000081271 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Vmn1r132-201ENSMUST00000098736 894 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 AC156790.4-202ENSMUST00000228838 1418 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Gm12788-201ENSMUST00000119090 308 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Gm20659-201ENSMUST00000176599 604 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Gm3650-201ENSMUST00000180600 747 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Gm27001-201ENSMUST00000182252 936 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Ptma-202ENSMUST00000186255 768 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Gm28585-201ENSMUST00000187587 442 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Gm36974-201ENSMUST00000194200 1071 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Gm45401-201ENSMUST00000209456 733 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 AC152169.2-201ENSMUST00000224558 613 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Gm14746-201ENSMUST00000120309 741 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Tmsb15l-201ENSMUST00000127404 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Gm4540-201ENSMUST00000170669 429 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Gm17075-201ENSMUST00000171924 670 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 1700051K13Rik-201ENSMUST00000204426 696 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Olfr44-203ENSMUST00000216316 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 AC134537.3-201ENSMUST00000220154 503 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Clec2g-202ENSMUST00000075789 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Olfr44-201ENSMUST00000077757 1071 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms