Protein–RNA interactions for Protein: Q03402

Crisp3, Cysteine-rich secretory protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crisp3Q03402 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms