Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.6 ms