Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.42□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC9.42□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC9.41□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms