Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Pitx2P97474 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Pitx2P97474 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Pitx2P97474 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Pitx2P97474 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
Pitx2P97474 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pitx2P97474 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pitx2P97474 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pitx2P97474 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pitx2P97474 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pitx2P97474 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pitx2P97474 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pitx2P97474 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms