Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gabpb2P81069 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gabpb2P81069 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Gabpb2P81069 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gabpb2P81069 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gabpb2P81069 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gabpb2P81069 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Gabpb2P81069 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gabpb2P81069 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Gabpb2P81069 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gabpb2P81069 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gabpb2P81069 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gabpb2P81069 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gabpb2P81069 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gabpb2P81069 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gabpb2P81069 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gabpb2P81069 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gabpb2P81069 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gabpb2P81069 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gabpb2P81069 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gabpb2P81069 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gabpb2P81069 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gabpb2P81069 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gabpb2P81069 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Gabpb2P81069 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gabpb2P81069 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gabpb2P81069 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gabpb2P81069 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gabpb2P81069 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gabpb2P81069 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gabpb2P81069 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gabpb2P81069 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gabpb2P81069 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gabpb2P81069 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gabpb2P81069 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gabpb2P81069 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gabpb2P81069 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gabpb2P81069 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gabpb2P81069 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gabpb2P81069 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gabpb2P81069 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gabpb2P81069 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gabpb2P81069 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gabpb2P81069 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gabpb2P81069 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gabpb2P81069 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gabpb2P81069 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gabpb2P81069 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gabpb2P81069 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gabpb2P81069 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gabpb2P81069 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gabpb2P81069 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gabpb2P81069 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gabpb2P81069 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gabpb2P81069 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gabpb2P81069 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gabpb2P81069 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gabpb2P81069 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gabpb2P81069 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gabpb2P81069 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gabpb2P81069 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gabpb2P81069 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gabpb2P81069 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gabpb2P81069 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gabpb2P81069 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gabpb2P81069 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gabpb2P81069 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gabpb2P81069 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gabpb2P81069 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gabpb2P81069 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gabpb2P81069 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gabpb2P81069 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gabpb2P81069 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gabpb2P81069 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gabpb2P81069 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gabpb2P81069 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gabpb2P81069 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gabpb2P81069 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gabpb2P81069 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gabpb2P81069 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gabpb2P81069 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gabpb2P81069 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gabpb2P81069 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gabpb2P81069 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gabpb2P81069 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gabpb2P81069 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gabpb2P81069 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gabpb2P81069 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gabpb2P81069 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gabpb2P81069 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gabpb2P81069 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gabpb2P81069 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gabpb2P81069 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gabpb2P81069 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gabpb2P81069 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gabpb2P81069 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gabpb2P81069 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gabpb2P81069 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gabpb2P81069 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gabpb2P81069 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms