Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Tp53bp1P70399 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Tp53bp1P70399 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Tp53bp1P70399 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Tp53bp1P70399 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Tp53bp1P70399 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Tp53bp1P70399 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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