Protein–RNA interactions for Protein: P62746

Rhob, Rho-related GTP-binding protein RhoB, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhobP62746 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RhobP62746 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RhobP62746 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RhobP62746 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RhobP62746 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
RhobP62746 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RhobP62746 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
RhobP62746 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
RhobP62746 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
RhobP62746 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RhobP62746 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RhobP62746 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
RhobP62746 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
RhobP62746 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RhobP62746 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RhobP62746 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RhobP62746 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RhobP62746 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RhobP62746 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RhobP62746 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RhobP62746 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RhobP62746 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RhobP62746 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RhobP62746 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RhobP62746 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
RhobP62746 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RhobP62746 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RhobP62746 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RhobP62746 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RhobP62746 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RhobP62746 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RhobP62746 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RhobP62746 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RhobP62746 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RhobP62746 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RhobP62746 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RhobP62746 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RhobP62746 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RhobP62746 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RhobP62746 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RhobP62746 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RhobP62746 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RhobP62746 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RhobP62746 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RhobP62746 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RhobP62746 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RhobP62746 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RhobP62746 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RhobP62746 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RhobP62746 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RhobP62746 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RhobP62746 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RhobP62746 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RhobP62746 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RhobP62746 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RhobP62746 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RhobP62746 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RhobP62746 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RhobP62746 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RhobP62746 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RhobP62746 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RhobP62746 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RhobP62746 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RhobP62746 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RhobP62746 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RhobP62746 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RhobP62746 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RhobP62746 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RhobP62746 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RhobP62746 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RhobP62746 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RhobP62746 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RhobP62746 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RhobP62746 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RhobP62746 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RhobP62746 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RhobP62746 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RhobP62746 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RhobP62746 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RhobP62746 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RhobP62746 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RhobP62746 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RhobP62746 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RhobP62746 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RhobP62746 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RhobP62746 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RhobP62746 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RhobP62746 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RhobP62746 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RhobP62746 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RhobP62746 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RhobP62746 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RhobP62746 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RhobP62746 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RhobP62746 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RhobP62746 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RhobP62746 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
RhobP62746 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
RhobP62746 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RhobP62746 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms