Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rhbdl3P58873 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rhbdl3P58873 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhbdl3P58873 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhbdl3P58873 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhbdl3P58873 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhbdl3P58873 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms