Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Cldn18P56857 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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