Protein–RNA interactions for Protein: P49962

Srp9, Signal recognition particle 9 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp9P49962 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Srp9P49962 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Srp9P49962 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Srp9P49962 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Srp9P49962 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Srp9P49962 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Srp9P49962 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Srp9P49962 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Srp9P49962 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Srp9P49962 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Srp9P49962 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Srp9P49962 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp9P49962 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp9P49962 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp9P49962 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp9P49962 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp9P49962 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp9P49962 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp9P49962 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp9P49962 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp9P49962 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp9P49962 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp9P49962 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp9P49962 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp9P49962 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp9P49962 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp9P49962 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp9P49962 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp9P49962 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp9P49962 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp9P49962 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp9P49962 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp9P49962 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp9P49962 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp9P49962 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp9P49962 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp9P49962 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp9P49962 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp9P49962 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp9P49962 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp9P49962 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp9P49962 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp9P49962 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp9P49962 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp9P49962 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp9P49962 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp9P49962 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp9P49962 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp9P49962 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp9P49962 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp9P49962 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp9P49962 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp9P49962 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp9P49962 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp9P49962 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp9P49962 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp9P49962 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp9P49962 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp9P49962 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp9P49962 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp9P49962 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp9P49962 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp9P49962 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp9P49962 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp9P49962 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp9P49962 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp9P49962 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp9P49962 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp9P49962 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp9P49962 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp9P49962 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp9P49962 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp9P49962 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp9P49962 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp9P49962 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp9P49962 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp9P49962 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp9P49962 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp9P49962 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp9P49962 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp9P49962 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp9P49962 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp9P49962 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp9P49962 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp9P49962 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp9P49962 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp9P49962 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp9P49962 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp9P49962 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp9P49962 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp9P49962 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp9P49962 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp9P49962 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp9P49962 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp9P49962 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp9P49962 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp9P49962 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp9P49962 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Srp9P49962 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Srp9P49962 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms