Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
VdrP48281 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
VdrP48281 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
VdrP48281 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
VdrP48281 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
VdrP48281 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
VdrP48281 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
VdrP48281 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
VdrP48281 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
VdrP48281 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
VdrP48281 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
VdrP48281 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
VdrP48281 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
VdrP48281 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
VdrP48281 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
VdrP48281 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
VdrP48281 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
VdrP48281 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
VdrP48281 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
VdrP48281 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
VdrP48281 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
VdrP48281 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
VdrP48281 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
VdrP48281 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
VdrP48281 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
VdrP48281 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
VdrP48281 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
VdrP48281 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
VdrP48281 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
VdrP48281 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
VdrP48281 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
VdrP48281 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
VdrP48281 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
VdrP48281 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VdrP48281 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VdrP48281 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VdrP48281 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
VdrP48281 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VdrP48281 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
VdrP48281 Gm5860-202ENSMUST00000151038 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VdrP48281 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VdrP48281 2010110E17Rik-201ENSMUST00000184161 879 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
VdrP48281 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
VdrP48281 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VdrP48281 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
VdrP48281 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
VdrP48281 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
VdrP48281 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VdrP48281 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VdrP48281 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VdrP48281 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VdrP48281 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VdrP48281 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VdrP48281 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VdrP48281 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VdrP48281 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VdrP48281 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VdrP48281 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VdrP48281 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VdrP48281 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VdrP48281 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VdrP48281 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
VdrP48281 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VdrP48281 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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VdrP48281 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VdrP48281 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VdrP48281 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VdrP48281 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VdrP48281 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VdrP48281 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VdrP48281 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VdrP48281 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VdrP48281 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VdrP48281 Fbxo40-202ENSMUST00000114806 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VdrP48281 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
VdrP48281 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VdrP48281 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VdrP48281 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
VdrP48281 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VdrP48281 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VdrP48281 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VdrP48281 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
VdrP48281 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VdrP48281 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
VdrP48281 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
VdrP48281 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VdrP48281 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VdrP48281 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
VdrP48281 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VdrP48281 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
VdrP48281 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VdrP48281 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VdrP48281 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VdrP48281 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VdrP48281 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
VdrP48281 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VdrP48281 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
VdrP48281 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VdrP48281 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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