Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrprbP47758 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrprbP47758 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrprbP47758 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrprbP47758 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrprbP47758 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrprbP47758 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SrprbP47758 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SrprbP47758 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrprbP47758 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.2 ms