Protein–RNA interactions for Protein: P47242

Pax9, Paired box protein Pax-9, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax9P47242 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax9P47242 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pax9P47242 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pax9P47242 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pax9P47242 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Pax9P47242 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax9P47242 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax9P47242 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms