Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Nedd4P46935 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Nedd4P46935 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms