Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms