Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Grik2P39087 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Grik2P39087 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Grik2P39087 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Grik2P39087 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Grik2P39087 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Grik2P39087 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Grik2P39087 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Grik2P39087 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Grik2P39087 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Grik2P39087 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Grik2P39087 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Grik2P39087 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Grik2P39087 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Grik2P39087 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Grik2P39087 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Grik2P39087 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Grik2P39087 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Grik2P39087 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Grik2P39087 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Grik2P39087 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Grik2P39087 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Grik2P39087 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Grik2P39087 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Grik2P39087 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Grik2P39087 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Grik2P39087 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Grik2P39087 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Grik2P39087 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Grik2P39087 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Grik2P39087 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Grik2P39087 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Grik2P39087 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Grik2P39087 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Grik2P39087 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Grik2P39087 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Grik2P39087 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Grik2P39087 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Grik2P39087 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Grik2P39087 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Grik2P39087 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Grik2P39087 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Grik2P39087 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grik2P39087 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grik2P39087 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grik2P39087 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grik2P39087 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grik2P39087 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grik2P39087 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grik2P39087 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Grik2P39087 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grik2P39087 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grik2P39087 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grik2P39087 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grik2P39087 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grik2P39087 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Grik2P39087 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grik2P39087 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Grik2P39087 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Grik2P39087 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Grik2P39087 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grik2P39087 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grik2P39087 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grik2P39087 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grik2P39087 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grik2P39087 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grik2P39087 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Grik2P39087 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grik2P39087 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grik2P39087 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grik2P39087 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grik2P39087 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grik2P39087 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grik2P39087 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grik2P39087 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grik2P39087 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grik2P39087 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grik2P39087 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grik2P39087 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grik2P39087 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grik2P39087 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Grik2P39087 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grik2P39087 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grik2P39087 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grik2P39087 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grik2P39087 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grik2P39087 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grik2P39087 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grik2P39087 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grik2P39087 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Grik2P39087 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Grik2P39087 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Grik2P39087 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Grik2P39087 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Grik2P39087 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Grik2P39087 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Grik2P39087 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Grik2P39087 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Grik2P39087 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Grik2P39087 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms