Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms