Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms