Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprmP28828 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprmP28828 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprmP28828 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprmP28828 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprmP28828 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprmP28828 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprmP28828 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PtprmP28828 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprmP28828 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprmP28828 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprmP28828 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtprmP28828 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtprmP28828 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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