Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RxraP28700 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RxraP28700 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RxraP28700 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RxraP28700 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RxraP28700 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RxraP28700 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RxraP28700 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RxraP28700 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RxraP28700 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RxraP28700 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RxraP28700 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RxraP28700 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RxraP28700 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RxraP28700 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RxraP28700 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RxraP28700 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RxraP28700 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RxraP28700 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RxraP28700 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RxraP28700 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RxraP28700 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RxraP28700 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RxraP28700 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RxraP28700 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RxraP28700 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RxraP28700 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RxraP28700 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RxraP28700 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
RxraP28700 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RxraP28700 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
RxraP28700 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RxraP28700 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RxraP28700 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
RxraP28700 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
RxraP28700 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RxraP28700 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
RxraP28700 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RxraP28700 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RxraP28700 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RxraP28700 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RxraP28700 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RxraP28700 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
RxraP28700 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RxraP28700 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RxraP28700 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RxraP28700 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RxraP28700 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RxraP28700 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RxraP28700 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RxraP28700 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RxraP28700 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RxraP28700 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RxraP28700 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RxraP28700 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RxraP28700 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RxraP28700 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RxraP28700 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RxraP28700 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RxraP28700 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RxraP28700 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RxraP28700 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
RxraP28700 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
RxraP28700 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RxraP28700 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RxraP28700 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RxraP28700 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RxraP28700 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RxraP28700 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RxraP28700 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RxraP28700 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
RxraP28700 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RxraP28700 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RxraP28700 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RxraP28700 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RxraP28700 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RxraP28700 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RxraP28700 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RxraP28700 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RxraP28700 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RxraP28700 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RxraP28700 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RxraP28700 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
RxraP28700 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
RxraP28700 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RxraP28700 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RxraP28700 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RxraP28700 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RxraP28700 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RxraP28700 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RxraP28700 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RxraP28700 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RxraP28700 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RxraP28700 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RxraP28700 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RxraP28700 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RxraP28700 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RxraP28700 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RxraP28700 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RxraP28700 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms